製薬会社で、日本企業に限るなら、 第一三共  武田薬品 アステラスの三社が、大企業に当てはまりますか？ また、給料面や、知名度の点で上記の三社に及ぶ製薬会社はありますか？  

売り上げ、規模等で言えば、あなたの言う専業三社ですかね。 最近は大塚製薬も売り上げで言えば、そこに食い込んできてます。 給料の比較は手当て、働き方等でばらばらなのでなかなかむずかしいところですが エーザイはメーカー（製薬に限らず）の中でもトップ水準を目指すと以前言っていました。 正直、製薬業界は他のメーカと違って、一般人の知名度と売り上げ、規模の 相関はありません。 なぜなら、ほとんどを占める医療用医薬品は薬事法でテレビCMできないため CMできる一般用医薬品（売り上げは安い）を多く売る企業が知名度が高くなります。 いい例は一般用医薬品を売らないアステラスは企業CMのみなので 大正製薬、エスエス製薬、大幸薬品（ラッパのマークの正露丸）の方が売り上げは小さいですが有名です。