バイト先のタイムカードの改ざんについて。 スーパーでアルバイトをしてる大学生です、宜しくお願いします。

所属している部署の主任が変わり、「有給消化して下さいね」と言われたことが発端なのですが、ずっと有給はないと前主任と前店長に言われていて不思議に思いながらも立場のある人間の発言なので信頼していました。 主任交代と同時に嘘が解り、知識のなかった自分も悪いのですが、これは他にも誤魔化されている可能性があると思って事務所のＰＣから勤務実績を見たところ、主任が変わる前後で明らかに残業分の勤務時間が実労働時間に含まれていないことが解りました。 毎日平均１０～２０分の残業をしているのですが、約１０か月間において含まれていませんでした。改ざんを誤魔化そうとしたのか所々に５分や８分の残業がついているのですが、ほぼ９割ぐらい実労働時間が18：00-22：00＝04:00のようになっていました。 18時ちょうどに出勤を切ることはまずありえないですし、22時ちょうどに切れた日も数える程しかありません。 少し調べたところ、賃金全額払いの原則というものがあって、1分単位で労働に対し賃金を支払わなければならず、30分未満を切捨てしても良いのは1か月の総労働時間の30分未満に対してのみ。と説明されている文章を多く見かけるのですが、この解釈はあっているのでしょうか？また、ワタミの賃金未払いとこの件は類似ですか？ こういったケースの場合、請求すれば未払い分を頂けるのでしょうか？ 詳しい方のご回答を頂けると嬉しいです。まとまりのない文章ですみません、宜しくお願いします。