私は将来任天堂に就職したいと思っている高校一年生です。

基本的には逆順で考えた方がいいです。 質問主さんが将来任天堂に提供できる技能は何？ ↓ その技能を最大化できる進学先はどこ？ ↓ そのために入試までに学習すべきことは何？ こう考えれば選択科目で悩むことなんてないです。 質問に即して検討事項を広げると以下のような感じです。 営業職とか事務職あるいは総合職なら科目関係ないので、まあ大学のレベルだけ考えとけばいいです。 任天堂は京大から入る人が多いですね。 大学入試時点で主さんが京大のボーダーに達しやすいのは物理と生物どっちでしょう。 その他専門技能職ならそれぞれの専門技能が必要です。 法律だったりデザインだったり。 例えば物理を活かすとしたらシステムエンジニア職とかハードウェア設計職とかエフェクト系のデザイン職とかでしょうか。 生物を活かせる可能性があるとしたらゲームプランナー職ぐらいですが就職時点ではあまり関係ないでしょう。 大学入試時点で物理と生物で取れる点数が全く同じ場合には生物を選ぶメリットは特になさそうです。