JICA 国際協力機構等に就職が決まった場合は入社、あるいは入庁になるのでしょうか。 ・ それとも他の呼び方になるのでしょうか。

独立行政法人ですから、官庁に準ずる組織ですので、「入庁」がふさわしい。 https://www.jica.go.jp/index.html 独立行政法人制度とは、各府省の行政活動から政策の実施部門のうち一定の事務・事業を分離し、これを担当する機関に独立の法人格を与えて、業務の質の向上や活性化、効率性の向上、自律的な運営、透明性の向上を図ることを目的とする制度です。 独立行政法人の業務運営は、主務大臣が与える目標に基づき各法人の自主性・自律性の下に行われるとともに、事後に主務大臣がその業務実績について評価を行い、業務・組織の見直しを図ることとされています。