傷病手当金について、

勤務5年で、去年の８月会社の事情で、本部に転籍する事になったのですが、転籍するにあたり、社会保険番号が代わりました。 ８月から１月まで働き、２月３月と育児休暇をとったのですが、目眩や不眠で仕事が出来る状態でなかったので、 子供が４月から保育園に入る事もあり、4月は育児休暇をやめて、有給で1ヶ月休みました。 月末になっても治らないので、精神科に診てもらうと、鬱の診断結果だったので、 傷病で休む事にさせて貰いました。 6月に入って、傷病手当金の申請を出すと、 確定金額が18万ちょっとでした。 そこから社会保険や、税金を会社が建て替えていた分を引かれる通知が届きました。 入社してから、毎月の総支給が36万前後で、 12ヶ月平均の額の3分の2の額が振り込まれると思っていたのですが、この額では生活が出来ないので、質問させて頂きました。 申請前に育児休暇を取り、1ヶ月有休を取ったからなのか、 去年の8月に転籍をして、社会保険番号が変わったからなのか、 申請前に12ヶ月継続して給料を貰っていなかったからなのか、 会社が申請を間違えているのか、 無知なもので、分かる方教えて頂きたいです。 宜しくお願いします。補足傷病手当申請は5月1日から、6月1日です。