僕は将来JR東日本に就職したいと考えています。

どうやらJRでは 総合職＝ポテンシャル採用 現業職＝プロフェッショナル採用 と呼んでいるようです。 ですので質問者さんの考えと逆です。 駅員・車掌・運転士などは現業職（運輸）の採用からですね。 もちろん運輸以外の職もありますから規模の大きいJRとなると現業職の採用人数はかなり多いようです。 総合職は４年制大学卒業以上でないと応募できません。 これは他の鉄道会社などもですが、やはり総合職となればかなり優秀な人間を求めます。 大学の中でもかなり上の部類の人たちが殆どですし、高校卒は応募できないのはもちろんの事、大学卒でも相当な狭き門となっています。 現業職に関しては高卒・短大卒・大卒・専門卒と採用枠も広めと言えば広めです。 と言っても高校卒は指定校求人なので応募する段階で条件がありますし、大卒などでも人気は高いので狭き門ではありますが。 それでも高校卒から採用され、将来的には運転士になれる可能性はあります。 ただ、ポテンシャル採用（総合職）でも１～２年程度は運転士として乗務するケースもあるようです。 総合職でも採用後は現場に配置されて経験を積むのですが、JRなどでは運転士も経験する場合があるようで。 免許を取得し単独常務となるので免許取得までの期間もかかりますが、それでも一部の人には経験してもらうようです。 なので総合職でも短期間ながら運転士になる場合もある、という事ですね。 大卒より高卒の方が扱いが良いと言う事はないと思います。 ただ高卒の方が４年早く就業できる分、有利になっている部分はあります。 運輸職であれば18歳で入社した人は21歳ぐらいで車掌になっていたりしますから、22歳で入社する大卒よりも早く経験を積むことはできますし。 大手企業であれば高卒入社でも世間の一般的な大卒者と大きく変わらない待遇だったりしますし、高卒で入れるのであればそちらの方が良い事もあるかとは思います。 （この辺は各々の考え方もあるのでどうとは言えませんが）