東京消防庁の消防総監にはⅠ類消防官ではなく、専門系消防官が就任するのが通例なのでしょうか？

そのように理解して間違いではないでしょう。 現在の部長級幹部はほぼ「大卒甲」区分で採用された消防吏員です。 旧採用区分では大学卒業者は「大卒甲」「大卒乙」に分かれており、この大卒甲は幹部要員とされ消防司令までは順当に昇任できるシステムでした。 その名称は「大卒甲」⇒「専門系」、「大卒乙」⇒Ⅰ類に変化していますが、根底にある概念は変わってはいません。 論文で半自動昇任する甲に対し、乙は副士長試験から順次階段を上がることになります。 その採用比率も変化はなく数百人規模の乙（Ⅰ類）に比して甲（専門系）は１０名程度です、自ずと採用目的がここからも読み取れるはずです。ただし現在は専門系採用者を公的に幹部要員と明言していません。