新卒で独立行政法人に入るのと準公務員である高速道路各社に入るのだったらどちらがおすすめですか？

独立行政法人と言っても100程度あります。すなわち、ピンキリです。民間と競合しいつでも解散、統合、民営化できる法人もあれば民間と競合することなく独占に近い法人もあります。 また、高速道路会社は特殊会社ですが分割されていますので各社によって異なります。JRも分割民営化されていますが、JR東海や東日本のように好調なところもあればJR貨物やJR北海道のように赤字を垂れ流している会社もあるのと同様です。 したがって、単に独立行政法人と高速道路会社どちらがいいかは比較できません。具体的にどこの独立行政法人と高速道路会社かを明確にしないと何とも言えないというのが結論です。