就職について質問です。

全く同じですよ。 高校の指定校求人に差はありません。 何から何まで公正な扱いします。 前者は毎年応募者が有るわけじゃ無いけど可能性に期待して求人を送ります。 後者は高校としては一番就職に強い偏差値帯。 就職希望者が多く、それは層が厚いということなので、勉強以外のヒューマンスキルに優れた生徒が応募してくれる事を期待して求人を送ってます。 採用者（OB/OG）も多く、信頼度からその学校からの推薦者は毎年期待されます。 こう考えると、偏差値49の学校の方が良いと言えるかもしれませんね。