自分が一番操作に慣れていて、練習できる環境にあるバージョンを選べばよいと思います。
2010はもう5年前ですが、つい去年までは2003のMOSも実施されており、
実際企業ではまだ使っているところだってあります。
企業では、2010を使っているところがまだまだ多いと思います。
あとは、2010と2013では試験の形式が違います。
2010は一問一答形式、2013は成果物作成形式です。
どちらの方が良いかご自分で判断してください。
(個人的には2010のほうが取得しやすいとは思います)
がんばってください。