宇宙工学はJAXAのほんの一領域ですよ。簡単に言えばロケットに応用できる制御理論や、材料、機械の事です。 物理や化学の方が比重は大きいです。 質問の件ですが、 就職実績はあるし、JAXAや宇宙研で卒論書いた学生は少なくないです。 ただ、博士が原則。少なくとも修士は必要です。ホームページの採用情報を見ておく事です。 論文のテーマはプラズマの測定や粒子線解析など物理固有のテーマで、宇宙工学ではないです。工学に関心があるなら機械工学や情報工学になります。
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少なくとも宇宙工学は必須かと。 また、宇宙科学研究所で研究職につきたいなら、大学院進学も頭に入れておかないと厳しいかと思います。 頑張ってください。
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